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科学家开发新方法 能预测单个细胞在未来几小时内的状态

作者: 来源: 发布时间:2017年12月10日

    来源:科技日报

     作者:刘海英

科技日报华盛顿8月8日电(记者 刘海英)美国哈佛大学医学院和瑞典卡罗林斯卡医学院研究人员8日在《自然》杂志上发表研究论文称,他们开发出一种能够监视细胞决策的新方法,可通过细胞内信使核糖核酸(mRNA)的状况来预测细胞细胞在未来几小时内的状态。

细胞作为人体基本的结构和功能单位,是人体器官功能发挥的决定性因素。对细胞的深入研究是改造生命、    征服疾病的关键。而RNA丰度则是描述单个细胞状态的重要指标。随着技术进步,科学家们已经能够通过单细胞RNA测序揭示RNA丰度,对单个细胞进行分析,但这种方法只能在某个时间点捕获细胞活动的“静态快照”,难以用于分析如胚胎形成、组织再生等会随时间而发生变化的生理过程。而此次哈佛医学院和卡罗林斯卡医学院推出的研究成果,能够将细胞活动的“静态快照”转变成“动态短片”,让科学家通过一次分析就能了解细胞的动态发育路径。

这一新方法实际上是一种数学模型。该模型将RNA作为预测因子,通过区分普通单细胞RNA测序中未剪切和    剪切的mRNA来估算RNA速度,也就是基因表达状态随时间变化的情况,进而预测单个细胞在未来几小时内的状态。依靠这一模型,科学家就可以监测细胞的决策行为,预测其发展方向。为验证模型准确性,研究人员进行了一系列实验,测试结果表明,该模型准确性极高,预测结果与细胞实际发育情况完全相同。

对细胞决策行为进行监测,预测其未来发展路径,将有助于科学家更好地分析复杂组织和器官中的细胞功能,监测器官的发育情况,深入了解器官如何在细胞水平上对特定药物或治疗产生反应,这对于人类疾病研究具有重要意义。

该研究论文的共同资深作者、卡罗林斯卡医学院分子系统生物学教授史坦�林纳尔松就表示,新方法不仅有助于揭示大脑的正常发育过程,同时也为深入了解精神分裂症、自闭症等人类大脑发育障碍提供线索,这令他们特别兴奋。

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